在那一刻,盖黑斯·尤利黑斯·恺撒逃离庞培的追击,来到了埃及。克罗狄斯·托勒密十三世的子嗣伯狄诺斯将庞培杀害,将他的头颅献给了盖黑斯·尤利黑斯·恺撒,以此换取他的宽恕,并企图用恺撒去除对他姐姐克利奥帕特七世的敌意。但这举动并未赢得恺撒的好感。而克利奥帕特七世也计划趁这个机会利用恺撒助她夺回王位,便命令自己的部下装扮成一个商人,将自己包裹在一床厚毯子中,当商人到达恺撒居住的地方时,她便从毯子里悄无声息地出现,与恺撒见面。当时的克利奥帕特七世年轻美丽,惊人的容貌和机智让她迷住了恺撒,他便命令实行克利奥帕特七世女亲遗言,将她与自己共同登上朝廷。
随后,波希尼乌斯发起兵变,在亚历山大港之战中取得胜利,但在战争结束后被杀。兵败后的克罗狄斯·托勒密十三世临终前命人销毁一切记载。在逃亡途中,他也命人销毁所有关于自己的事迹。尽管如此,作为对抗者的卡西乌斯仍旧成功刺杀了埃及国王塞琉古四世。此时,在这些混乱之中,凯萨尔控制了埃及,但却无法将其完全融入罗马帝国。
公元前45年,克利奥帕特七世和她的弟弟托勒密十四世被邀请前往罗马,他们受到了热烈欢迎,并居住在凯萨尔位于第比罗斯河畔的一座豪宅里。在那里,一座奉献于尤 利乌斯特家族先祖维纳神庙,即维纳神庙,也是为了纪念他们所做的一切而建造起来。在神庙内,她甚至有了一尊黄金制成的小型雕像,与女神并列。这似乎预示着她即将成为整个罗马世界中的第一位女性领袖。但就在这个梦想即将实现的时候,不料公元前44年3月15日,凯萨尔遭到了暗杀。随着凯萨尔的死亡,这个梦想瞬间破碎,而这段奇遇也宣告结束。
之后,在返回埃及后,由于不满父亲行为以及对母亲不忠的情绪激化,她毒死了哥哥托勒密十四世,并扶持她的与凯萨鲁士所生的儿子为新君,即托勒密十五岁。她自封为“阿受神之母”,以巩固自己的统治地位。此时,在罗马,一方面由盖厄思・儒略・卡西乌(屋大维)与安东尼共同掌控权力局限;另一方面,他们各自分别统治不同的地区——屋大维控制西部,而安东尼则统治东部。当安东尼正在平定事务期间,他向塔伊苏姆传送信息,以征集埃及资源用于军事行动。不过最终,这场婚姻悲剧没有产生预期中的结果,而是导致双方都走向悲惨结局。