在这段历史的转折点上，盖黑斯·尤利黑斯·恺撒逃离了庞培的追击，来到了埃及，他面前站着的是克罗狄斯·托勒密十三世。伯底诺斯献上了庞培的头颅给恺撒，以此换取他的宽恕和理解。此举并没有赢得恺撒的心意，而是引起了他对姐姐克利奥帕特拉七世的怀疑。而克利奥帕特拉七世则利用这一机会，与恺撒建立了联系，她假扮成一个商人，将自己包裹在一床厚重毯子中，被送到恺撒住所。当时年轻貌美的她，用自己的魅力和机智迷住了恺撒，他被她的外表和聪明才智所吸引，最终命令将她的女亲王遗言付诸实践，让她与托勒密十三世共同执掌朝政。
随后，波希尼乌斯发动兵变，在亚历山大港战役中取得胜利，但最终兵败被杀。失势的托勒密十三世也选择逃亡而死。恺撒征服了埃及，但并没有将其纳入罗马帝国。他与克利奥帕特拉七世之间的情感纽带越来越紧，这份感情最终导致他们共同生下了一名女儿，她被命名为菲罗巴塔尔·菲洛朱提亚，即“小盖黑斯·尤利黑斯·恺撒”。同时，恺撒还恢复了她的王位。
公元前45年，克利奥帕特拉七世以及她的弟弟托勒密十四世一起受邀前往罗马，他们受到盛情款待，并居住在位于第比路岛上的凯 撒公邸。在那里，凯 撒履行了自己的誓言，为他的尤里乌斯家族先祖建造了一座维纳神庙，并将克 利 奥 帕 特 拉 七 世 的黄金塑像安置于女神旁边。这几乎让她成为古罗马世界中的第一夫人。但就在这个高潮之际，一场悲剧发生：公元前44年3月15日，凯 撒遭到暗杀身亡。克 利 奥 帕 特 拉 七 世 的美好梦想瞬间破碎，她不得不离开罗马返回埃及。
回到埃及后，克 利 奥 帕 特 拉 七 世毒死了她的弟弟托勒密十四世，然后联合与凯 撒生的儿子——即将登基的托勒密十五世独自统治整个国家。在这时期内，他们宣称他是阿瑞乌斯神之子。而在罗马方面，不幸中的万幸，由于分权制度，本就有两个领导者：屋大维控制西部，而安东尼控制东部。在一次短暂停歇后的军事行动之后，当安东尼准备向塔索苏（今土耳其）进军以获取资源供战争用途时，他传递消息给已经落单回来的克 利 奥 帕 特 拉 七 世。她却未能再次获得那个曾经属于她们共享的地位。