在这段历史的转折点上,盖撒·尤利乌斯·恺撒逃离了庞培的追击,来到了埃及,他站在克罗德斯·托勒密十三世面前,将庞培的头颅奉献给他,以此换取他的宽容。然而,这并未赢得恺撒的心。克里奥帕特拉七世也看准这个机会,想借助恺撒帮助她夺回王位,便命令自己的侍女以贩夫贩妇的身份伪装成一名商人,与恺撒同行。当时年轻美丽的克里奥帕特拉正值盛年,她凭借自己的魅力和机智,最终迷住了恺撒。他命令按照克里奥帕特拉七世母亲遗嘱,让她与托勒密十三世共同登基。
随后,波希尼乌斯发动政变,在亚历山大港战役中获胜,但最终被杀害。战争结束后,托勒密十三世在逃亡途中遇刺身亡。尽管如此,恺撒仍然占据了埃及,并试图将其纳入罗马帝国。不过,他最终没有实现这一目标。在接下来的岁月里,克里奥帕特拉七世与恺撒共度余生,并生下了一子,即菲洛巴塔尔·菲洛图斯·凯萨——“小盖萨”。同时,她还复辟了她的王位。在公元前45年,当她和另一个弟弟托勒密十四世被邀请到罗马时,他们受到了极大的礼遇,并居住在凯萨的一座宅邸旁边。
凯萨履行了誓言,在罗马为他家族建立了一座维纳神庙,并把一尊黄金泥塑像放在女神旁边。这似乎预示着她即将成为整个罗马世界中的第一夫人。但就在公元前44年3月15日,不料凯萨遭到暗杀而死。不久之后,她梦碎于空留前往埃及。她毒死了弟弟,然后扶持她的与凯萨所生的儿子作为托勒密十五世独自统治埃及。此时,一说他们是由阿瑞斯之子降临,而另一说则是由天上的神明赐予力量。而在罗马,则有屋大维和安东尼两个养子争夺权力,他们分别控制西部和东部地区。安东尼曾企图通过向克里奥帕特拉传递信息来获取资金用于军事行动,但最终失败收场。