《了不起的儿科医生》讲述了发生在儿童医院的故事，有喜也有甜。小宇是焦佳人的第一个病人，两人关系可很好，可是小宇却出车祸去世了，让焦佳受打击。
陆正宇约焦佳人在公交站见面，神秘地说要带他去看“森林”，坐了几站下车后，小宇让焦佳人闭着眼睛把她带到了一处高建筑物的天台上。
小宇把耸立的楼宇当做大树，天台就成了“森林”的一部分，他还把天台上废弃的桌子绘上了五彩斑斓的颜色，放眼望去，远看是壮观的都市景象，近处是浓郁的艺术气息，焦佳人惊叹：这里太美了。此时此刻，她的童年被一个孩子治愈了，她第一次感到，当一个儿科医生是如此幸福，这将是她一生中永远的精神财富。
陆正宇又没有考好，妈妈暴跳如雷，规定以后不到一点不许睡觉，这时她接到姐姐电话，催她还钱，小宇妈妈心情糟透了。小宇回到房间收到了焦佳人的信息，询问了他的考试成绩，担心他被妈妈骂，焦佳人的关心让小宇的心里暖暖的，但他没告诉焦佳人实情。
第二天，小宇妈妈拿着红包到学校送给陈老师，恳求她让小宇继续借读，被老师断然拒绝后，小宇妈妈绝望地哭了起来，陈老师劝她，以小宇的成绩留在这里压力更大，倒不如转到竞争不那么激烈的学校，成为中上游，但小宇妈妈不能接受，不停地哭求，老师不堪其扰，起身上课去了。二人的对话被门口的小宇听到，他心里难受极了。晚上，小宇偷偷给焦佳人打电话聊了两句，仍然没说这事。妈妈回到家就没给小宇好脸色，在客厅不停给辅导老师打电话央求他们再给小宇加加课。
次日早上，小宇妈妈给他留了早饭后上班去了，懂事的小宇看到妈妈生病了还坚持去上班心里难受极了，他想到自己拿不出手的成绩，妈妈的暴怒和眼泪，家里经济的拮据，这一切压得他喘不过气。小宇默默收拾完学习用品后，把焦佳人约到了天台上，他告诉焦佳人，妈妈的生日快到了，他准备在生日那天给妈妈写封信，他知道妈妈喜欢鲜花，但平时她把所有的钱都花在了自己学习上，从来不舍得买，小宇准备买束鲜花送给妈妈当生日礼物，但他拒绝焦佳人陪同，坚持一个人去买。焦佳人搂着懂事的小宇，告诉他：会陪着他慢慢长大。
万没想到，小宇在买鲜花的路上出了车祸，妈妈哭成了泪人儿，焦佳人飞奔到急诊室参与抢救，她紧握小宇的手让他坚持住不要睡，王航启用了二次心脏复苏，但遗憾的是小宇最终没能恢复心跳，焦佳人流着泪眼睁睁地看着小宇走了，急诊室外小宇妈妈号啕痛哭。
焦佳人回到值班室呆坐着一言不发，她无法接受前二天还和自己谈笑风生的小宇就这样走了，邓子昂想替焦佳人请几天假调整一下，焦佳人没有接受，继续投入忙碌的工作中。