他出生在江苏省涟水县一个普通的劳动人民家庭；生父早年参加革命，不幸牺牲；继父是一个中层干部，怀着抚育烈士遗孤的责任感，对韩爱晶要求严格而不失疼爱。然而，韩爱晶却总感到在家庭里难以寻求到温暖，从小养成了孤僻、郁闷的性格。后考上北京航空学院。
文化大爆发初期，韩爱晶在去国防科委“”的28个昼夜空前活跃而坚定，一跃成为名噪一时的北航“红旗”战斗队的“总勤务员”。他还成为北京航空学院委员会主任、“首都大专院校红代会”核心小组副组长、北京市委员会。
同其他几位“学生领袖”一样，韩爱晶在1968年7月以后的派性武斗中受到了严厉批评。随后，工人阶级思想宣传队进驻学校，强制实行联合复课闹；从此，韩爱晶走下了舞台，并被羁押和监督劳动。他最终被依法判处有期徒刑15年，并剥夺权力3年。
1987年，他出狱之后，被分配至湖南株洲兵工厂工作，然后调至深圳，一直担任国企参股公司总经理等职务。他的罪行包括诬陷徐向前、陈毅、叶剑英，以及对彭德怀元帅进行逼供和殴打，最终导致彭德怀元帅身心受到重创。在经历了一系列争权夺利和派性斗争后，由于高校造反派之间产生流血冲突和派系之间不断扩散，他开始意识到需要稳定局势，因此提议派工宣队进驻高校，但这也遭到了部分人的抵抗与反弹，最终使得他的地位逐渐被冷落。此事至今仍然是中国历史上的一个重要事件之一。