李开元所述，吕马童的身世不明，他被归类为秦人。据记载，在汉朝初年，即公元前206年的春季，吕马童在今陕西省乾县东部好畤地区担任郎中骑将，与刘邦同属一军。在公元前204年的十一月，他与韩信共同参与了对龙且的战争，这场胜利使他得以晋升为骑司马。
随后在汉五年的十二月，吕马童又加入了垓下之战，当时西楚霸王项羽自刎于乌江亭。他与其他两位郎中骑杨喜和吕胜，以及杨武一起分割了项羽的遗体，因功受封为中水侯。
数年之后，在汉文帝十年的某一年（约公元前170年），吕马童去世，被谥号庄侯。他的子嗣继承了爵位，其中有名的是儿子吕假，也称作“瑕”。后来，爵位传给了孙辈中的一个成员——吕青眉，然后是孙子的儿子——吕德，最终到达曾孙——吕宜城。但是在汉武帝元鼎五年的某一年（大约是公元前115年），因私欲夺取官职而失去了爵位。
《史记·项羽本纪》提到了一个趣闻：在项羽兵败身亡之前，他曾经称呼过吡马童为“故人”，但关于两人如何相识以及他们之间关系的具体细节，并没有留下明确的记录。