南京失陷
在明朝末年，李自成领导的农民起义军攻占了南京，这标志着清朝统治者入主中原。南京失陷导致大量文物损毁和历史资料丢失，对中国文化产生了深远影响。李自成虽然后来被清军打败，但他的行动已经不可逆转地改变了明朝的命运。
三藩之乱
万历帝晚年，由于政治腐败和经济困难，引发了一系列地方割据现象。孙传庭、石rose等人各自独立称王，形成“三藩”对抗中央政府。这场内战耗费巨大的人力物力，同时削弱了国家实力，为外敌入侵创造了条件。
东林党争
万历年间，“东林党”与“西狭门派”的斗争激化，不断影响到皇权与宦官之间的关系，最终导致宦官势力的上台，如魏忠贤等人的专权造成国政混乱，使得国家行政效率低下，加剧社会矛盾。
崇祯时期的一系列自然灾害
崇祯时期（1627-1644），频繁发生洪水、旱灾、大疫等自然灾害严重破坏农业生产，增加了人民负担，加速了社会动荡局势的恶化，并为农民起义提供了理由和条件。
明末学术界衰微
随着政治体制的变革和社会经济形态的变化，传统儒家学说逐渐不能适应新的时代需求，而科举制度也出现问题，以至于产生了一批只会空谈不懂实际应用知识的人才，这些因素共同作用下，使得学术界出现衰退现象。