政治腐败蔓延
在元朝后期，政治腐败问题日益严重。皇权集中导致官员之间的斗争和贪污行为普遍存在。一些高级官员利用手中的权力进行不正当得利，甚至将国家财政资源转化为个人私囊。在这种情况下，中央集权制度失去了它原本的效能，使得国家管理出现严重混乱。
外患加剧
同时，从13世纪末到14世纪初，蒙古帝国开始衰落，其边疆地区发生了多次内战和民族矛盾激化的情况。这导致了一系列边境小国和部族纷纷独立或者对元朝进行攻击，如红巾军起义、明清交替等，这些都给予了元朝巨大的冲击。此外，由于忽必烈派遣子孙至中原统一中国后，对汉人采取了一些政策以保持其统治地位，如强制使用蒙古语而非汉语，这也引起了广泛不满，最终促成了明朝建立。
经济危机深入
随着时间的推移，元代经济逐渐陷入困境。首先是农业生产力下降，土地兼并现象愈发严重，大量农民被迫成为佃户或流离失所者，而政府因缺乏有效措施而无法缓解这一问题。此外，由于战争频繁、交通阻塞以及贸易路线改变等原因，全社会商品流通受到极大影响，加之金币贬值使得货币购买力的减少，不仅普通百姓生活难以为继，即使是官僚阶层也不免受牵连。
社会动荡不安
社会上出现了种种矛盾和冲突。一方面，是由于长期的战争与征服造成的人口损耗及文化冲击；另一方面，是由于宗教信仰上的分歧，如佛教徒与道教徒之间，以及基督教传入后的信众数量增加，与既有宗教体系相互竞争带来的紧张关系。此外，在地方上，也出现了一系列民变事件，比如白莲宗起义等，这些都加速了社会动荡局势。
文化衰退
最后，一直以来作为文化交流桥梁的地理位置优势开始丧失。唐宋时期相对开放的政策让中国文化扩散至世界各地，但到了元代，该过程逆转了方向。在内忧外患之际，当时许多学者艺术家选择逃往其他地方寻求庇护，而留下的则面临着思想封闭与文艺创作的大幅度减少。因此，在科技创新、文学艺术等领域，都表现出了明显衰退趋势，为未来可能发生更大规模变革埋下伏笔。