杨君兴，云南省昆明市知名的鱼类分类、进化和种群生态学专家。自1986年开始工作以来，他一直致力于研究云南及其周边地区的淡水鱼类系统分类、进化和生态学。在此期间，他主编了一部专著，合编了五部，并在国内外期刊上发表了40多篇论文。他还获得了两次云南省自然科学二等奖，其研究成果对中国科学院昆明动物研究所以及全球生物多样性保护具有重要意义。
杨君兴的研究重点包括：
鱼类分类进化：通过结合形态与分子手段，对我国淡水鱼类进行系统分类、系统发育和谱系地理研究。
珍稀土著鱼类生态与保育：在中国科学院昆明动物研究所珍稀鱼类保育研究基地开展驯养繁殖工作，成功培育了滇池金线鲃等珍稀物种。
水生生物多样性调查与监测：对高原湖泊和江河中的水生生物进行考察和监测，为湿地恢复提供科学依据。
湿地恢复：采用自然恢复方式，在滇池成功恢复湿地，并形成“花-鱼-蚌”的立体恢复模式。
他的代表性成果包括探讨抚仙湖23种土著鱼类的生物学特性的形成及其适应环境变化，以及对白鱼属、倒刺鲃属及角鱼属等物种分支系统学理论的贡献。此外，他还发现并描述了新的魚類屬，並對高原鳅、雲南鳅等物種進行分化調查。
杨君兴承担过多个国家级项目，如973项目“中国-喜马拉雅地区生物多样性演变和保护研究”以及国家自然科学基金重点项目“三江并流区特有魚類譜系地理分化”。他在《Science》杂志上也有文章发表，受到国际认可。