石蕴三与樊锥同为清朝末年拔贡出身。戊戌变法期间，湖南巡抚陈宝箴倡导新思想，创办了时务学堂、南学会及时报馆等机构。谭嗣同、梁启超、熊希龄、陈三立、唐才常、樊锥和石蕴三都参与了这些活动。当变法失败后，陈宝箴等人被革职，而石蕴三等人则遭通缉。他们逃往山区避难，最终在光绪二十六年（1900年）八月参与了汉口起义，但因追缉不得不再次逃往上海。在那里，他们得到了蔡锷的资助，并于光绪二十九年（1903年）留学日本。他先后进入弘文师范学校和法政大学学习，并在1911年的辛亥革命中积极参与。
返回中国后，他担任船山学社社长，并组织成立了湘学会，以推动学生反抗清政府。在宣统三年（1911年），广州起义失败后，他以“鲁仲连”和“屈大夫”的挽联表达对国家的忠诚。随着辛亥革命的胜利，他拒绝入仕，不愿意接受政治职位。他继续致力于教育事业，在1920年代撰写了一系列著作，如《老学今诠》、《政谈续》、《燕尘录》等。
然而，当他晚年的作品遭受日军轰炸并在长沙文夕大火中丢失时，他深感悲痛。他最终因病去世，但他的精神仍然激励着人们。这位杰出的思想家和教育家虽然生活艰苦，但他的遗产依然丰富多彩，为历史上的一代知识分子树立了榜样。
