1865年乙丑1月27日（农历乙丑年元旦），名懋质，又名元吉，后易名质，字朴存，号滨虹。原籍徽州歙县潭渡村，诞生于浙江金华府城西之铁头岭寓所。13岁随父返歙县应童子试，名列前茅。丁戊间，易字宾虹，以字行。
1869年己巳，地方不靖，随父避乱至金华山居罗店，并师从李灼先、李咏棠习举业。在课余时间，他尤爱好金石书画，从萧山倪翁处闻“当如作字法，以笔笔亦分明”画诀。
1870年庚午，在家塾藏有《字汇》等书，可以粗知字有形声之谊。此时，他在金华山中读书习画甚勤。
1871年辛未，有族侄黄崇惺以庶吉士分发福建归化，为订课程并游八咏楼。他也曾请篆刻名家赵穆刻“黄质之印”、“朴丞”、“朴丞翰墨”诸印。
1874年甲戌，他研习了族祖黄白山《字诂》及黄春谷《梦陔堂文说》、《经说》。此外，还学习五经，并从赵经田、应芹生、李灼先、李咏棠问学五经毕业后习为诗人。
1886年丙戌，他补廪生，并向汪仲伊学习古代书法。此时他已婚，与妻洪夫人（名四果）结连理。
1892年壬辰，他弃取士业而至南京坐馆教书。此后数次迁居，不断探索和记录历史文物故事，为其作品增添深度和意义。
1903年癸卯，他垦荒成堨田二百七十余亩，并撰写了《滨虹集印存》，其中记载了他对历史文物的研究和收藏，以及对艺术创作的思考和实践过程。
1910年代初期，在上海定居期间，他积极参与文化教育活动，与国学保存会等组织合作，如同盟会喉舌《报》的创刊工作。他还任职于留美预备学堂，并参与编纂美术丛书等多项文化事业，其作品涉及绘画、文章、诗歌以及鉴赏批评等多个领域，是中国近现代文学史上的重要人物之一，同时也是中国古代绘画史上的一位杰出代表人物，对推动中国传统艺术与西方艺术交流起到了关键作用。
