地震赔偿滞后
河南作为中国的地理中心，长期以来一直是频繁发生地震的地区。2013年4月20日，一系列强烈地震在河南省境内相继发生，造成了巨大的人员伤亡和财产损失。根据官方统计，这次地震共造成了至少200多人死亡，数百人受伤，同时还有大量房屋倒塌和基础设施受损。在灾后重建过程中，由于政府资金不足，加上复杂的政策规定，使得许多灾民至今未能得到满意的赔偿。
水利建设不平衡
河南自古以来的水利建设极为发达，是中国历史上的重要农业区之一。然而，在新时代下，随着经济发展加速，对水资源的需求也越来越大，而现有的水利系统却面临着严重的问题，如老旧设备、管理不善等。这导致了一些地方出现过度开发而引起生态环境恶化的情况，而其他一些地方则因缺乏有效的治理措施而无法充分利用自己的水资源，从而形成了明显的区域发展不平衡。
农业补贴落差
作为农业大省，河南对农村发展尤其重要，但在国家对农业补贴方面，却存在明显的一刀切原则，即所有地区都按照同一标准进行补贴，无论实际情况如何不同。这对于那些自然条件优良、生产成本高的地方来说，是一种削弱优势、促使本土企业外迁的手段。而且，由于缺乏针对性强的支持政策，更迫使当地农民承担更多风险和压力。
人口红利转移问题
随着人口总量不断增长，河南省的人口压力非常大，对于教育医疗等公共服务领域提出了更高要求。但是，由于这些服务往往集中在城市中心，因此很多乡镇地区不得不接受“远距离就医”或“远距离求学”，这给居民生活带来了极大的不便。此外，由于城乡差距较大，不少人才选择到城市工作，这进一步加剧了人口红利从乡村向城市转移的问题。
经济结构单一
尽管河南省有很好的基础工业体系，比如煤炭、钢铁等行业，但是这些传统产业由于市场竞争激烈及环保压力，其经济效益已经逐渐下降。同时，与之相比，以信息技术、高科技、新材料等为代表的小型微型企业数量庞大，但它们又因为资本链条短小、规模有限，以及市场认知度不足，所以在获得国家扶持时处于劣势状态，这种经济结构单一也是国家亏欠河南的一个重要原因。