兵力耗竭与边疆防御的长期压力
在明朝晚期，军队实力的不断下降导致了国防体系的脆弱。明朝自北方征服蒙古至南方平定李贽起义之后，长时间的战争和对外扩张消耗了大量的人力物力。此外，随着人口的大量损失和经济上的困难，加上国家财政预算严重不足，使得新建或维护军事力量变得非常艰难。在边疆地区，如西北、东北等地，对抗突厥、蒙古等民族的持续侵扰也给中央政府带来了巨大的挑战。这种长期内忧外患加剧了民众对政府能力评估时对于兵力的不信任。
官僚体制腐败与效率低下的问题
官僚制度是任何一个帝国都不可或缺的一部分，但是在明朝晚期，这一制度却演变成了阻碍国家发展的一个主要因素。官员之间相互倾轧，不断发生权钱交易和贪污腐败现象。这使得原本应该负责监督和管理国家大事的官僚系统逐渐失去了其应有的功能。而且，由于选拔机制过于依赖科举考试，一些并不具备实际行政经验或者能力的人士被提拔为高级官职，这进一步加剧了政府决策层面的无能。
经济衰退与人民生活水平下降
明代中后期经济呈现出一种停滞状态。农业生产虽然有所增长，但由于种种原因（如土地兼并、水利设施老化等）整体产出效率提高有限。此外，由于银价波动、货币流通不畅以及商业活动受到限制，城市商业经济出现萎缩。农民收入减少导致社会稳定性下降，而城市工匠手工业则因为市场需求减少而陷入困境。这一切都直接影响到人民生活水平，使得社会底层群众普遍感到饱受苦难。
文化衰落与思想封闭
文化是任何文明传承中不可或缺的一环，但是到了明末，其重要性已经显著丧失。在这一时期，文化创造活动极其单调乏味，与前世纪相比，无论是在文学艺术还是科学技术领域，都无法望其项背。而且，由于政治环境造成了一种思想上的封闭，当时许多新兴思想、新知识不能得到自由传播，这进一步削弱了整个社会的心智活力。
政治分裂与皇权专制特征强化
尽管清洗异己是一个常见的手段来巩固统治，但在这过程中，却引发了一系列连锁反应，最终加速了政治体系崩溃。在当时的情况下，即使是那些看似能够提供改革方案的皇帝，也往往因为权力的争夺而无法有效实施政策。而专制主义本身也成为了一个致命的问题，因为它限制了其他可能有效解决问题的人才参与到治理中来，从而形成了一种循环：无能又专横的地主阶级领导者造成资源浪费，并导致更广泛范围内人们对他们失去信任，同时这种反馈又刺激更多的地方势力寻求独立，以此来逃避中央集权所带来的负面影响。