古埃及神祇众多，核心有九柱神：推掌太阳之力，舒守风雨；泰芙努特赐降雨火，盖布领年月光；努特覆天幕，奥西里斯统冥界种植；伊西斯守死生育爱，塞特激风暴雷霆；奈芙蒂斯护屋宇亡灵。辅以次要神祇，如阿图姆日落太阳的末端，托特智慧与书写之主；玛特秩实理公正，为妻者于智慧中形象鹭鸶。安比斯引魂归谷，其形狼尾人身保卫死亡旅程，而荷鲁斯复兴之翼为法老防御者，以鹰之姿飞翔。
此外，还有哈托尔爱情与欢乐女神，以及她的丈夫荷鲁斯，他们共同守护着恋爱和婚姻的美好。而底比斯三柱中的阿受、姆特以及孔苏则代表了创造、生殖和时间的力量。在孟斐斯三柱中，有普塔塑造艺术与建筑，再加上其子那妇特姆动物的奇迹。此外还有阿努凯特保护河流不被干扰，以及克仆姆与萨提特在僧罗河畔守护着生命。
其他重要神祇还包括阿吞即使成为主要信仰之一，即太阳本身，而敏则是游览者的保护者，同时也是死产和支获的司令官。而涅伊特则是佃猎取编织者的女神，与索贝克相伴。而荷鲁斯四个儿子，则分别负责去世者的肝脏、肺部、胃部以及肠道，每一个都在维持去世者的身体功能方面发挥着至关重要的作用。
植物世界中也有许多神祇，比如凯布利用圣甲虫带来新生的光芒，而塞赫麦德是一位母狮，在孟斐斯三柱中占据一席之地。她妹妹巴斯特也是一位猫头鹰，用她温柔的手抚慰那些悲伤的心灵。而蛇女神瓦凶得以保卫下埃及，让它免遭侵袭。最后，还有许多其他小型但重要的地面和水域生物，如鳄鱼、三角洲豹子等，它们各自扮演着独一无二的地位。