李开元认为吕马童是秦人。公元前206年,吕马童以郎中骑将的身份加入刘邦的队伍,在今陕西乾县东好畤一带。两年后,他在十一月参加了韩信领导的对龙且之战,并逐步升至骑司马。十二月,他又参与了垓下之战。在项羽自刎于乌江亭之后,吕马童与杨喜、吕胜、杨武共同分割了项羽的尸体,因功被封为中水侯。
汉文帝十年(公元前170),吕马童去世,被谥号为庄侯。他的儿子吕假继承了爵位,然后是他的孙子吕青肩,再到孙子的孙子——吕德和曾孙——吕宜成。但在汉武帝元鼎五年的某个时候,吕宜成因贪图金钱而失去了爵位。
《史记·项羽本纪》中提到,在面对失败和死亡之前,项羽曾称呼吕马童为“故人”,但关于他们之间具体关系的详细信息并没有留传下来。