在洪荒时代，神族是最为强大的存在，他们统治着一个充满魔法和奇迹的世界。三皇，是指这三个最为高贵、最具影响力的神王，他们分别掌管着天、地和水。在这个世界里，每一位神都有自己的领域，但他们之间也存在着复杂的权力斗争。
第一章：古老传说
在遥远的过去，一切都是混沌不清。当时，宇宙中只有一片无边的大海，那是洪荒之源。而从这片大海中诞生了第一个神——太初真君。他创造出了天地，并且自己成为天帝，开始了他的统治。但他很快就意识到自己的孤独，他想要创造出伴侣。于是，就有了女娲氏，她能够操控火焰和土壤，为的是创造出生命来丰富这个空旷而冷漠的宇宙。
随后，太初真君与女娲氏结合，产生了两个孩子——二祖文昌和二祖武俊。这两兄弟各自拥有不同的特质，他们分别被赋予控制风雨（文昌）和山川（武俊）的能力。在这之后，三皇便成为了掌控自然元素的人物，他们共同维护着宇宙的平衡。
第二章：权力斗争
随着时间流逝，不断有人对三皇进行挑战，这些挑战者通常来自于其他族群，如妖魔鬼怪等。不过，无论他们多么强大，最终还是无法改变三皇的地位。然而，在一次意外事件中，一名叫做青龙的小仙竟然成功打败了武俊，从而夺走了一部分他的力量。这让整个洪荒界都震惊，因为这是第一次有人敢于挑战并且胜利过来的凡人。
此事引起了文昌与青龙之间的一场激烈战斗，最终文昌以其更高级别的法术击败了青龙，将他封印起来。此举进一步巩固了三皇的地位，同时也给予普通人类希望，让他们相信即使弱小，也能通过努力改变命运。
第三章：末日降临
就在人们以为一切安稳的时候，一种新的威胁出现，它们被称作“异兽”。这些生物似乎来源于另一个空间，而它们所拥有的力量则超乎想象。它们开始侵扰整个洪荒界，对所有生物造成巨大的威胁。不仅如此，这些异兽似乎还有某种特殊目的，即要摧毁现有的秩序，以建立新世界观。
面对这样的危机，三皇不得不团结起来，以防止全面的毁灭。在漫长而艰苦的战斗中，他们发挥出了各自独特的能力，最终将异兽赶到了边缘。但在过程中，也失去了许多宝贵的人类同盟者，以及一些重要的地方守护者，使得整体防线变得更加脆弱。
第四章：隐秘揭晓
虽然暂时赢得了解放，但实际上只是延缓了一段时间的事态发展。一股新的力量已经悄然觉醒，它来自于那些被封印已久的地球精灵们。当地球精灵觉醒后，与自然相连，可以操控大地本身，这导致原本由文昌管理的地面层出现裂痕，从而给予敌人大量资源供用。而当地球精灵联合起来形成强大的联盟时，其实力超过任何单个人的想象范围。这种情况下，只有极少数智慧人物才会发现这一点，并试图寻找解决之道，而绝大多数却仍沉浸在现状中的安全感里不知道未来可能带来的灾难是什么样子。
正当人们以为一切都会重新回到正常状态时，却突然间发生了一件令人震惊的事情——太初真君消失！没有任何迹象表明他的去向，只留下一句谜语：“我将返回，却不是你期望中的那一刻。”这让所有人陷入深深恐慌之中，因为如果真君回来了，却不是以前那个保护我们的人，那么整个宇宙将会迎来怎样的变革？
《三皇隐秘》讲述的是这样一个故事，其中隐藏着关于信仰、勇气以及变化不可测性的话题。这是一个关于未知未来的探索，是关于如何应对前所未有的困境的一个测试。如果你还记得最初的情景，那么现在，你是否依旧认为世间万物皆已定局？